PCR法扩增盐藻叶绿体atpA基因

目的:克隆杜氏盐藻叶绿体atpA基因片段。

方法:把GenBank中近10种藻类的atpA全基因的氨基酸序列进行比较,设计简并引物,利用PCR方法从盐藻叶绿体DNA中扩增atpA基因片段,然后胶回收所扩片段并与T-vector相连,转化大肠杆菌JM109,挑阳性克隆鉴定,并测序,再将序列与所选藻类有关序列比较同源性。

结果:从盐藻叶绿体基因组中扩增出约400bp的片段。测序结果显示此片段长405bp,推导的氨基酸序列与莱茵衣藻的同源性为92%,普通小球藻为88%,原始绿藻为87%,卵形肾藻为86%,Cyanidioschyzonmerolae为85%。